Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdpd3Q99LY2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms