Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms