Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp16Q99LG0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Usp16Q99LG0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp16Q99LG0 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp16Q99LG0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp16Q99LG0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp16Q99LG0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp16Q99LG0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp16Q99LG0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp16Q99LG0 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp16Q99LG0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms