Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms