Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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