Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms