Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubxn4Q8VCH8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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