Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcsapQ8QZT2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CcsapQ8QZT2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms