Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lin28aQ8K3Y3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lin28aQ8K3Y3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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