Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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OptnQ8K3K8 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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OptnQ8K3K8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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OptnQ8K3K8 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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OptnQ8K3K8 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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OptnQ8K3K8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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OptnQ8K3K8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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OptnQ8K3K8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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