Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Abcf3Q8K268 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Abcf3Q8K268 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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