Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Usp44Q8C2S0 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Usp44Q8C2S0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp44Q8C2S0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp44Q8C2S0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp44Q8C2S0 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp44Q8C2S0 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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