Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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