Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rbbp5Q8BX09 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms