Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp40Q8BWR4 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp40Q8BWR4 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp40Q8BWR4 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp40Q8BWR4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp40Q8BWR4 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp40Q8BWR4 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp40Q8BWR4 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp40Q8BWR4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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