Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp38Q8BW70 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Usp38Q8BW70 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usp38Q8BW70 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms