Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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ChfrQ810L3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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ChfrQ810L3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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ChfrQ810L3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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ChfrQ810L3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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ChfrQ810L3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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