Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atg2bQ80XK6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms