Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Pcsk9Q80W65 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pcsk9Q80W65 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pcsk9Q80W65 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pcsk9Q80W65 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pcsk9Q80W65 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pcsk9Q80W65 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pcsk9Q80W65 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pcsk9Q80W65 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pcsk9Q80W65 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pcsk9Q80W65 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pcsk9Q80W65 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pcsk9Q80W65 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pcsk9Q80W65 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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