Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccp110Q7TSH4 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms