Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms