Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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