Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
CenpeQ6RT24 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CenpeQ6RT24 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms