Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp49Q6P9L4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp49Q6P9L4 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp49Q6P9L4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp49Q6P9L4 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp49Q6P9L4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp49Q6P9L4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp49Q6P9L4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp49Q6P9L4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp49Q6P9L4 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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