Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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