Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms