Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q6DFW0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms