Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Atg9aQ68FE2 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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