Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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Ccdc18Q640L5 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc18Q640L5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc18Q640L5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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