Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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