Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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DbpQ60925 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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DbpQ60925 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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DbpQ60925 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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DbpQ60925 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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DbpQ60925 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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DbpQ60925 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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DbpQ60925 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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DbpQ60925 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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