Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms