Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf3Q60765 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms