Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spire1Q52KF3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms