Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp48Q3V0C5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp48Q3V0C5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp48Q3V0C5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp48Q3V0C5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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