Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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