Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms