Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms