Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp19Q3UJD6 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms