Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms