Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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