Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ccndbp1Q3TVC7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ccndbp1Q3TVC7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ccndbp1Q3TVC7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms