Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdnep1Q3TP92 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms