Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trappc10Q3TLI0 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms