Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prr27Q3SYJ2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Prr27Q3SYJ2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Prr27Q3SYJ2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Prr27Q3SYJ2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Prr27Q3SYJ2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Prr27Q3SYJ2 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Prr27Q3SYJ2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Prr27Q3SYJ2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms