Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms