Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptcd3Q14C51 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms