Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q149G0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q149G0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q149G0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q149G0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q149G0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q149G0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q149G0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q149G0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q149G0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q149G0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q149G0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q149G0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms