Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rpusd2Q149F1 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rpusd2Q149F1 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rpusd2Q149F1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rpusd2Q149F1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rpusd2Q149F1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rpusd2Q149F1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rpusd2Q149F1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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