Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp2b3Q0VF55 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp2b3Q0VF55 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms